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  • ·常規信息
    基因(座)名稱直立穗基因; 大穗基因
    erect panicle 3; LARGER PANICLE
    基因符號EP3; LP
    所在染色體2 (已克隆)
    供體材料Hep

    EP3(Os02g15950, Yu et al. 2015; LOC_Os02g15950, Piao et al. 2009), LP(LOC_Os02g15950, Li et al. 2011), 位于同一基因位點...

    【突變體表型】

    ep3突變體花梗中小維管束數量和穗軸粗壯度顯著增加,表現為直立穗(Piao et al. 2009)。

    lp的2個突變體的花枝梗增多,尤其是一級枝梗數目,籽粒數增加,突變體較野生型更抗倒伏,每株籽粒產量也相應增加(Li et al. 2011)。

    除了穗直立,Os02g15950功能缺失突變體的葉片光合能力和氣孔導度均減弱,氣孔保衛細胞小于野生型(Yu et al. 2015)。

    【定位與克隆】

    ep3位于2號染色體短臂上STS標記STS5803-5和STS5803-7之間的0.1cM區間,約46.8kb區間,包含6個侯選基因,通過DNA序列比較,與野生型相比,突變體的LOC_Os02g15950基因第2外顯子有個單堿基突變,推測這是一個無義突變(Piao et al. 2009)。

    【時空表達譜】

    LP編碼一個富含Kelch的F-box蛋白,原位雜交表明該LP集中在枝梗原基區域表達(Li et al. 2011)。

    【亞細胞定位】

    內質網

    【生物學功能】

    EP3在調節氣孔保衛細胞發育和氣孔導度中起作用,進而調控水稻的光合作用能力(Yu et al. 2015)。

    EP3是一個Fox蛋白,可能作為E3泛素連接酶的一個亞基,在識別和降解特定底物中發揮功能(Yu et al. 2015);LP能與SKP1-like蛋白互作,調節細胞分裂素氧化酶OsCKX2的水平,可能參與植物組織的細胞分裂素水平的調節,對改善水稻株型、提高產量有作用(Li et al. 2011)。

    【相關登錄號】
    contigs及其產物:AP008208BAF08395
    cDNAs及其產物:AK064350
    參考基因組位點:Os02g0260200(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os02g15950(本地MSU-RGAP
    參考基因組產物:NM_001053016NP_001046481
    uniprot庫登錄號:Q0E293
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    ·ONTOLOGY及相關基因
    表型特征氣孔導度(TO:0000522), 穗形(TO:0000262), 穗型(TO:0000089), 每穗粒數(TO:0002759), 倒伏率(TO:0000068), 光合作用能力(TO:0000316), 小維管束數目(TO:0000558), 一次枝梗數(TO:0000547)
    分子功能蛋白質結合(GO:0005515)
    生物進程細胞分裂素代謝過程(GO:0009690), 泛素和SCF依賴的蛋白酶體蛋白分解代謝過程(GO:0031146), 氣孔發育(GO:0010374), 光合作用調控(GO:0010109)
    細胞結構SCF類泛素連接酶復合物(GO:0019005)
    ·參考文獻
    1Hongyang Yu;Erik H. Murchie;Zinnia H. González-Carranza;Kevin A. Pyke;Jeremy A. Roberts
      Decreased photosynthesis in the erect panicle 3 (ep3) mutant of rice is associated with reduced stomatal conductance and attenuated guard cell development
      Journal of Experimental Botany, 2015, 66(5): 1543-1552
    2Ming Li;Ding Tang;Kejian Wang;Xinru Wu;Lili Lu;Hengxiu Yu;Minghong Gu;Changjie Yan;Zhukuan Cheng
      Mutations in the F-box gene LARGER PANICLE improve the panicle architecture and enhance the grain yield in rice
      Plant Biotechnology Journal, 2011, 9(9): 1002-1013
    3Rihua Piao;Wenzhu Jiang;Tae-Ho Ham;Min-Seon Choi;Yongli Qiao;Sang-Ho Chu;Jung-Hyun Park;Mi-Ok Woo;Zhengxun Jin;Gynheung An;Joohyun Lee;Hee-Jong Koh
      Map-based cloning of the ERECT PANICLE 3 gene in rice
      Theoretical and Applied Genetics, 2009, 119(8): 1497-1506
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