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    基因(座)名稱短穗基因;小肽轉運蛋白
    short panicle1;peptide transporter
    基因符號SP1; OsNPF4.1
    所在染色體11 (已克隆)

    SP1(Li et al., 2009), 與OsNPF4.1(Léran et al., 2014), 位于同一個基因位點...

    SP1 編碼一個可能的多肽轉運蛋白(peptide transporter, PTR),決定水稻穗長。

    水稻的穗型主要取決于一級枝梗枝和二級枝梗的數目和長度,在農學和發育生物學上都有重要意義。其中一級枝梗的位置和數量在植株從營養生長向生殖生長轉變的過程中就已經建立,一些調控穗分生組織活性的基因參與了這一過程。中國學者報道了一個水稻短穗突變體(short panicle1, sp1),它在稻穗伸長過程中有缺陷。SP1 基因在幼穗的韌皮部中高水平表達,其編碼產物包含一個具有12個跨膜域的保守PTR2功能域,SP1-GFP 融合蛋白定位于質膜上,因此SP1 編碼一個屬于多肽轉運蛋白家族的轉運蛋白。系統進化樹分析表明SP1 可能是硝酸鹽轉運蛋白,但是在卵母細胞和酵母中均未發現硝酸鹽轉運活性和由PTR 蛋白轉運的其它組分。現有結果表明,SP1 的轉運功能需要其它組分的參與或者其在單子葉植物中有未知底物(Li et al., 2009)。

    【基因克隆】

    SP1 cDNA 全長5257bp,5'-UTR: 171; 3'-UTR長度: 450,包含有5 個外顯子,編碼一個由626 氨基酸組成多肽轉運蛋白。sp-1-1: 來自中花11γ誘變;sp1-2: 來自日本晴TOS17插入庫,但第3個外顯子有一段31bp的缺失。

    【相關登錄號】
    cDNAs及其產物:AK100802
    參考基因組位點:Os11g0235200(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os11g12740(本地MSU-RGAP
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    ·遺傳(物理)圖譜
    #圖譜名稱連鎖群開始位置終止位置
    1日本晴序列注釋圖譜(2008)1171751027180358
    ·ONTOLOGY及相關基因
    表型特征穗長(TO:0000040)
    分子功能多肽轉運蛋白(GO:0015197)
    生物進程穗發育(GO:0010229)
    細胞結構質膜(GO:0005886)
    ·參考文獻
    1Sophie Léran;Kranthi Varala;Jean-Christophe Boyer;Maurizio Chiurazzi;Nigel Crawford;Françoise Daniel-Vedele;Laure David;Rebecca Dickstein;Emilio Fernandez;Brian Forde;Walter Gassmann;Dietmar Geiger;Alain Gojon;Ji-Ming Gong;Barbara A. Halkier;Jeanne M. Harris;Rainer Hedrich;Anis M. Limami;Doris Rentsch;Mitsunori Seo;Yi-Fang Tsay;Mingyong Zhang;Gloria Coruzzi;Benoît Lacombe
      A unified nomenclature of NITRATE TRANSPORTER 1/PEPTIDE TRANSPORTER family members in plants
      Trends in Plant Science, 2014, 19(1): 5-9
    2Li Shengben;Qian Qian;Fu Zhiming;Zeng Dali;Meng Xiangbing;Kyozuka Junko;Maekawa Masahiko;Zhu Xudong;Zhang Jian;Li Jiayang;Wang Yonghong
      Short panicle1 encodes a putative PTR family transporter and determines rice panicle size
      The Plant Journal, 2009, 58(4): 592-605
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