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  • ·常規信息
    基因(座)名稱稻瘟病抗性基因
    Pyricularia oryzae resistance-d3
    基因符號Pi-d3
    所在染色體6 (已克隆)
    供體材料地谷

    源自秈稻品種"地谷"的主效抗稻瘟病基因Pi-d3,對我國稻瘟病生理小種Zhong-10-8-14表現較高的抗稻瘟能力。

    由Mgnaporthe oryzae 引起的稻瘟病是最具毀滅性的植物病害之一。盡管亞洲栽培稻的兩個亞種,秈稻和粳稻,對稻瘟病表現出明顯的抗性差異,但是造成這種差異的基因組基礎卻并不清楚。核苷酸結合位點和富含亮氨酸重復(NBS-LRR)基因家族是水稻中一類主要的抗病基因家族,中國學者在全基因范圍內對秈稻93-11和粳稻日本晴中的NBS-LRR假基因成員進行了比對,結果發現這兩個基因組上假基因的分布和結構存在巨大的差異。根據全基因組比對結果,作者設計了大量基于PCR的分子標記,用以特異性擴增日本晴的的NBS-LRR假基因成員。這些標記與稻瘟病感病性狀是共分離的,因而可以用來對由抗病秈稻和感病粳稻為父母本獲得的后代分離群體的抗感情況進行鑒定。通過這種策略,他們在秈稻品種地谷中分離了一個新的抗稻瘟病基因Pid3。在大部分被測的粳稻品種中Pid3 基因轉錄起始位點開始的第2208位核苷酸處的無義突變導致了粳稻中的Pid3 基因成為了假基因。同時,這個位點的突變卻沒有在秈稻、非洲栽培稻或是AA組的野生稻中被檢測到。這些結果都說明粳稻品種Pid3 假基因化是發生在秈粳分化以后的(Shang et al., 2009)。

    【基因克隆與生物學功能分析】

    Pid3 cDNA 全長2970 bp,含有2 個外顯子,編碼一個由923 氨基酸組成的蛋白產物,產物含有NBS-LRR結構域和MHD基序。Pid3Nip 在LRR結構域中,轉錄起始位點開始的第2208位核苷酸處,CAG被替換為TAG。

    【相關登錄號】
    cDNAs及其產物:FJ773285;FJ773286
    參考基因組位點:Os06g0330100(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os06g22460(本地MSU-RGAP
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    ·遺傳(物理)圖譜
    #圖譜名稱連鎖群開始位置終止位置
    1日本晴序列注釋圖譜(2008)61312325413126028
    ·ONTOLOGY及相關基因
    表型特征稻瘟病抗性(TO:0000074)
    ·參考文獻
    1Jie Chen;Yongfeng Shi;Wenzheng Liu;Rongyao Chai;Yaping Fu;Jieyun Zhuang;Jianli Wu
      A Pid3 allele from rice cultivar Gumei2 confers resistance to Magnaporthe oryzae
      Journal of genetics and genomics, 2011, 38(5): 209-216
    2Junjun Shang;Yong Tao;Xuewei Chen;Yan Zou;Cailin Lei;Jing Wang;Xiaobing Li;Xianfeng Zhao;Meijun Zhang;Zhike Lu;Jichen Xu;Zhukuan Cheng;Jianmin Wan;Lihuang Zhu
      Identification of a New Rice Blast Resistance Gene, Pid3, by Genomewide Comparison of Paired Nucleotide-Binding Site–Leucine-Rich Repeat Genes and Their Pseudogene Alleles Between the Two Sequenced Rice Genomes
      Genetics, 2009, 182(4): 1303-1311
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