<td id="wiiig"><kbd id="wiiig"></kbd></td>
  • ·常規信息  最近更新:2020年11月6日 13:36:00
    基因(座)名稱籽粒大小
    regulator of grain size
    基因符號GS5
    所在染色體5 (已克隆)

    GS5(JN256055/JN256056, Li et al. 2016)...

    GS5編碼一個絲氨酸羧肽酶,正向調控水稻籽粒大小。

    【突變體表型】

    GS5高表達具有更大的籽粒(Li et al. 2011; Xu et al. 2015)。

    【定位與克隆】

    GS5位于第5染色體短臂的RM593和RM574之間。

    【時空表達譜】

    GS5等位基因具有節律性,在白天轉錄逐步增加。GS5在綠色組織中的表達量通常高于非綠色組織如莖稈、根、幼穗以及胚乳;非綠色組織中,GS5最高的表達量主要在長度為1-11cm的幼穗中;開花階段,外稃/內稃中GS5表達量顯著上調(Xu et al. 2015)。

    【亞細胞定位】

     

    【生物學功能】

    GS5編碼一個絲氨酸羧肽酶,是一個控制水稻粒寬、充實度和千粒重的數量性狀基因(Li et al. 2011)。

    GS5啟動子區域的兩個關鍵單核苷酸多態性(SNPs)造成水稻幼穗中GS5的差異表達,這決定了籽粒大小的差異。GS5表達增強會通過占據OsBAK1-7的胞外富亮氨酸重復(LRR)結構域,競爭性地抑制OsBAK1-7和OsMSBP1間的互作,進而阻止OsBAK1-7與OsMSBP1互作而產生的胞吞作用(Xu et al. 2015)。

    【相關登錄號】
    contigs及其產物:AP014961BAS92383
    基因及產物ID號:JN256057AEO37082, JN256058AEO37083
    cDNAs及其產物:JN256055AEO37080, JN256056AEO37081, AK106800
    參考基因組位點:Os05g0158500(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os05g06660(本地MSU-RGAP←→ LOC4337873(NCBI)
    參考基因組產物:XM_015785073XP_015640559
    uniprot庫登錄號:Q5W727
    將本文分享到:
    ·ONTOLOGY及相關基因
    表型特征籽粒大小(TO:0000397), 種子發育特征(TO:0000653), 籽粒產量(TO:0000396), 粒寬(TO:0000402), 千粒重(TO:0000592)
    分子功能絲氨酸羧肽酶活性(GO:0004185)
    生物進程細胞分裂的正向調節(GO:0051781), 種子發育(GO:0048316), 胞吞作用調節(GO:0030100)
    ·參考文獻
    1Chunjue Xu;Yu Liu;Yibo Li;Xiaodong Xu;Caiguo Xu;Xianghua Li;Jinghua Xiao;Qifa Zhang
      Differential expression of GS5 regulates grain size in rice
      Journal of Experimental Botany, 2015, 66(9): 2611-2623
    2Yibo Li;Chuchuan Fan;Yongzhong Xing;Yunhe Jiang;Lijun Luo;Liang Sun;Di Shao;Chunjue Xu;Xianghua Li;Jinghua Xiao;Yuqing He;Qifa Zhang
      Natural variation in GS5 plays an important role in regulating grain size and yield in rice
      Nature Genetics, 2011, 43(12): 1266-1269
    3Xing Y Z;Tan Y F;Hua J P;Sun X L;Xu C G
      Characterization of the main effects, epistatic effects and their environmental interactions of QTLs on the genetic basis of yield traits in rice
      Theoretical and Applied Genetics, 2002, 105(2-3): 248-257
    4Li J X;Yu S B;Xu C G;Tan Y F;Gao Y J;Li X H;Zhang Q F
      Analyzing quantitative trait loci for yield using a vegetatively replicated F2 population from a cross between the parents of an elite rice hybrid
      Theoretical and Applied Genetics, 2000, 101(1-2): 248-254
    5Y. F. Tan;Y. Z. Xing;J. X. Li;S. B. Yu;C. G. Xu;Qifa Zhang
      Genetic bases of appearance quality of rice grains in Shanyou 63, an elite rice hybrid
      Theoretical and Applied Genetics, 2000, 101(5-6): 823-829
    6Yu S B;Li J X;Xu C G;Tan Y F;Gao Y J;Li X H;Zhang Q F;Saghai Maroof M A
      Importance of epistasis as the genetic basis of heterosis in an elite rice hybrid
      Proceedings of the National Academy of Sciences, 1997, 94(17): 9226-9231
    中國農業科學院作物科學研究所 | 中國水稻研究所
    Copyright © 2008 CNRRI. All rights reserved. 中國水稻研究所科技信息中心 版權所有
    男人女人免费啪啪观看